A Unidade de Pesquisa do Centro de Referência e Treinamento em DST/AIDS (CRT-DST/Aids) foi estruturada no ano de 2001, em resposta ao convite que a instituição recebeu, em 2000, para participar de uma rede internacional de pesquisas de Vacinas Anti-HIV (HVTN).

O CRT coordena o Programa Estadual DST/AIDS de São Paulo e é um serviço de referência para atendimento a portadores de Doenças Sexualmente Transmissíveis (DST) e HIV/aids desde 1988, além de se constituir em uma unidade de referência de âmbito nacional e internacional para treinamentos de profissionais da saúde que atendem pacientes portadores dessas patologias.
A partir de 1995 o CRT passou a conduzir pesquisas de novos medicamentos para HIV/aids.

Fazer parte dessa rede internacional veio ao encontro da prioridade do Programa Nacional DST/AIDS e do Programa Estadual DST/AIDS de São Paulo, que é participar do esforço inter-nacional em busca de uma vacina anti-HIV.